自然条件下,三湖慈鲷主要有两个繁殖时间,一是春季,二是秋季。因为它有很多的品种,不同品种的具体繁殖时间可能会有所不同,但大多数品种都会在春季或者是秋季的时候繁殖。在人工养殖的环境之中,只要鱼儿已经性成熟,并且养殖环境条件相对适合繁殖,那么它们就有可能繁殖。

三湖慈鲷主要有两种繁殖方式。一部分品种是基质型繁殖,公鱼和母鱼会将鱼卵产到岩洞或者贝壳里面,然后母鱼孵化照顾鱼卵,公鱼洞外或者贝壳外面巡逻。这种繁殖方式的征兆是,母鱼不太游动,长时间处于产卵的岩洞或者贝壳旁边。而公鱼会在附近游动巡逻。
三湖慈鲷另一部分品种的繁殖方式是口孵型繁殖。母鱼会将产在底砂上,然后公鱼完成受精,母鱼再将受精卵含入口中,保护鱼卵。之后鱼卵会在母鱼的口中孵化。这种繁殖方式的特征是母鱼不吃食,嘴巴鼓起来,并且不怎么合群。口孵的时间大约是半个月左右,也有部分品种的鱼时间可能会稍长一些。
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